Выявление ДНК возбудителей инфекций мочевыводящих путей и обнаружение генов резистентности к полимиксинам, бета-лактамным, гликопептидным и фторхинолоновым антибиотикам методом ПЦР в режиме реального времени. Тест-система ИМП Таргет-Чек

Правила подготовки к исследованию

Взятие материала желательно проводить до диагностических и лечебных манипуляций в предполагаемом месте локализации возбудителя.

Взятие биологического материала рекомендуется проводить до начала применения лекарственных препаратов (антибактериальных, противовирусных, противопаразитарных). При проведении исследований в целях контроля лечения целесообразно проводить взятие проб не ранее, чем через 10-14 дней после окончания применения соответствующих препаратов локального действия и не ранее, чем через один месяц после проведения системной терапии.

Мочу собирают после тщательной гигиенической обработки наружных половых органов.

Следует собирать первую утреннюю порцию мочи в количестве 20-30 мл в стерильный контейнер.

Не рекомендуется взятие биоматериала на фоне проведения антибактериальной терапии.

Желательно соблюдать все описанные условия, если лечащим врачом не рекомендовано иное.

Показания для анализа «Выявление ДНК возбудителей инфекций мочевыводящих путей и обнаружение генов резистентности к антибиотикам»:

• диагностика острого и хронического цистита, пиелонефрита, уретрита, простатита;
• выявление этиологии инфекции при неэффективности предшествующей терапии;
• скрининг бессимптомной бактериурии (особенно у беременных);
• подбор рациональной антибактериальной терапии с учетом молекулярных маркеров резистентности.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: не обнаружено.

Формат представления результата

Качественный.

Возможные варианты результата: обнаружено, не обнаружено.

Интерпретация результатов исследования «Выявление ДНК возбудителей инфекций мочевыводящих путей и обнаружение генов резистентности к антибиотикам»

Обнаружено

Означает наличие ДНК конкретного микроорганизма в пробе. В заключении перечисляются все выявленные патогены.

Например:

«Выявлена ДНК бактерии(-й): уропатогенная E. coli серогруппы O25, Klebsiella pneumoniae».

Если обнаружен Candida albicans: «Выявлена ДНК возбудителя грибковой инфекции — Candida albicans».

Не обнаружено

Означает, что ДНК возбудителей ИМП в пробе не обнаружено.

В заключении:

«ДНК возбудителей инфекций мочевыводящих путей не обнаружена».

Если получен только результат ОБМ, это означает, что бактериальная масса присутствует, но видовой состав не соответствует панели (составу) теста (либо это редкий возбудитель, либо низкая концентрация).

В таком случае выдается заключение: «Видовая принадлежность возбудителя инфекции мочевыводящих путей не определена. Рекомендуется проведение дополнительного исследования (например, бактериологического посева)».

При обнаружении генов резистентности к антибактериальным препаратам в заключении указывается обнаруженный ген(-ы) и группа препаратов, к которым выявлена резистентность.

Например:

«Обнаружены гены резистентности: TEM, CTX-M-14/15 — к бета-лактамным антибиотикам; qnrB — к фторхинолоновым антибиотикам».

Или: «Обнаружен ген vanA/B — к гликопептидным антибиотикам (ванкомицин)».

Отсутствие генов резистентности указывает на отсутствие наиболее распространенных приобретенных генов.

Важно! Обнаружение гена резистентности не всегда означает клиническую резистентность in vivo, но является сильным предиктором.

Решение о назначении антибиотика принимает врач на основе совокупности данных, включая клинический ответ и локальные эпидемиологические данные.

• Если выявлен возбудитель, но нет генов резистентности, можно применять антибиотики из соответствующих групп с высокой вероятностью эффективности (но всегда с учетом локальной чувствительности).
• Если выявлены гены резистентности, но возбудитель не идентифицирован (например, только ОБМ) — это сигнал о возможной полимикробной инфекции или наличии микроорганизмов вне панели, требующих дополнительного исследования.
• Если не обнаружено ни возбудителя, ни генов, то с высокой вероятностью ИМП отсутствует, либо концентрация патогена ниже предела обнаружения теста (ниже 10^4 копий/мл).

Синонимы: ПЦР-диагностика инфекций мочевыводящих путей с определением генов антибиотикорезистентности; Молекулярно-генетическое исследование мочи на возбудителей ИМП и маркеры устойчивости к антибиотикам, Генодиагностика ИМП: идентификация патогенов и генов резистентности.

PCR-based UTI pathogen and antibiotic resistance gene detection; Real-time PCR panel for urinary tract infection pathogens and resistance markers, еxtended PCR susceptibility panel for urinary pathogens; Target Check. Identification of DNA of pathogens of urinary tract infections and detection of resistance genes to polymyxins, beta-lactam, glycopeptide and fluoroquinolone antibiotics by real-time PCR.

Краткое описание исследования «Выявление ДНК возбудителей инфекций мочевыводящих путей и обнаружение генов резистентности к антибиотикам»

В отличие от классического бактериологического посева, который требует большой срок выращивания и идентификации, при этом, не выявляя прихотливые микроорганизмы, ПЦР-анализ дает результат в течение 4-5 часов, позволяя врачу назначить целевую этиотропную терапию на раннем этапе.

Исследование обладает высокой аналитической чувствительностью (10^4 копий/мл) и 100% диагностической специфичностью.

Исследование позволяет выявить в моче:

• ДНК возбудителей инфекций мочевыводящих путей (как бактериальной, так и грибковой природы);
• гены лекарственной устойчивости к четырем основным группам антибиотиков: полимиксинам, бета-лактамным препаратам, гликопептидам и фторхинолонам.

Спектр выявляемых патогенов:

• грамотрицательные и грамположительные бактерии: Proteus mirabilis, Citrobacter spp., Enterobacter spp., Acinetobacter baumannii, Staphylococcus aureus, Staphylococcus saprophyticus, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pyogenes, Klebsiella pneumoniae;
• уропатогенные штаммы Escherichia coli (UPEC) серогрупп O1, O2, O4, O6, O7, O8, O15, O16, O18, O25 и O75;
• грибы Candida albicans.

Исследуемые маркеры резистентности:

MCR-1, TEM, SHV, GES, CTX-M-14/15, KPC, VEB, PER, NDM, IMP, VIM, CMY, DHA, OXA-23, OXA-24/40, OXA-48, OXA-51, OXA-58, mecA, vanA/B, qnrB/S.

С какой целью выполняют исследование

Для качественного выявления ДНK широкого спектра возбудителей инфекций мочевыводящих путей (ИМП) и одновременного обнаружения наиболее клинически значимых генов антибиотикорезистентности в моче

Что следует учесть при выполнении исследования

Нарушение правил подготовки к исследованию может повлиять на результаты тестов.

Литература

1. Виноградова А. Г., Кузьменков А. Ю. Практическое применение AMRmap: элементы подхода «от общего к частному» на примере Klebsiella pneumoniae // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2019. – Т.21. – № 2. – С. 181-186.
2. Кузьменков А. Ю. и др. AMRmap – система мониторинга антибиотикорезистентности в России // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2021. – Т.23. – №2. – С. 198-204.
3. Letarov A. V. Bacterial Virus Forcing of Bacterial O-Antigen Shields: Lessons from Coliphages // International Journal of Molecular Sciences. – 2023. – Т. 24. – № 24.
4. Whelan S., Lucey B., Finn K. Uropathogenic Escherichia coli (UPEC)-Associated Urinary Tract Infections: The Molecular Basis for Challenges to Effective Treatment // Microorganisms. – 2023. – Т. 11. – № 9.
5. Yang X., Chen H., Zheng Y., Qu S., Wang H., Yi F. Disease burden and long-term trends of urinary tract infections: A worldwide report // Frontiers in Public Health. – 2022. – Т. 10.