Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных полинейропатий (Whole exome sequencing of panel of genes for hereditary polyneuropathies)

Синонимы: Исследование панели генов наследственных полинейропатий по результатам полноэкзомного секвенирования.

Study of panel of genes for hereditary polyneuropathies using whole-exome sequencing results.

Полноэкзомное секвенировани панели генов наследственных полинейропатий

Болезнь Шарко-Мари-Тута

Наследственная нейропатия с предрасположенностью к

параличам от давления

Наследственные сенсорные и автономные нейропатии

Дистальные наследственные моторные нейропатии

Нейропатии, связанные со спастической параплегией

Семейная амилоидная полинейропатия

Нейропатии, связанные с митохондриальными заболеваниями

Нейропатии, связанные с наследственными атаксиями

Синдромальные нейропатии

Метаболические наследственные нейропатии

Генетическое заключение

Краткое описание исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных полинейропатий»

Полинейропатии – это группа заболеваний, характеризующихся поражением периферической нервной системы.

Полинейропатии подразделяются:

• по патогенетическому признаку на демиелинизирующие и аксональные;
• по характеру клинических проявлений: моторные, сенсорные, смешанные, вегетативные;
• по характеру течения: острые, подострые и хронические.

Причины возникновения полинейропатии включают:

• аутоиммунные заболевания;
• онкологические заболевания;
• инфекции;
• токсическое поражение;
• метаболические и эндокринологические заболевания.

Полинейропатия может быть как единственным проявлением таких болезней, так и частью системных проявлений. Наиболее частой и известной формой наследственной полинейропатии является болезнь Шарко-Мари-Тута. Для ряда наследственных неврологических заболеваний полинейропатия является одним из проявлений: спастические параплегии, митохондриальные заболевания, наследственные атаксии, амилоидная полинейропатия и др. Что такое полноэкзомное секвенирование?

Полноэкзомное секвенирование – это высокотехнологичный метод анализа ДНК, прочитывающий все белок-кодирующие участки генома (экзом), содержащие ~85% известных мутаций (патогенных вариантов). Полноэкзомное секвенирование выявляет:

• однонуклеотидные замены (SNV);
• малые инсерции/делеции (in/del) до 50 п.н.;
• некоторые вариации числа копий (CNV).

Когда исследование затруднено

Выявление некоторых типов вариантов методом экзомного секвенирования затруднено или невозможно. К таким вариантам относятся:

• структурные изменения хромосом (инверсии, транслокации, делеции, амплификации);
• полиплоидии;
• анеуплоидии;
• варианты, ассоциированные с протяженными участками триплетных и других повторов;
• варианты в генах с наличием в геноме близкого по последовательности псевдогена или паралога;
• варианты в GC-богатых участках;
• варианты в интронах за пределами канонических сайтов сплайсинга;
• эпигенетические варианты.

Метод имеет ограниченную чувствительность в отношении вариантов в состоянии мозаицизма.

Выполнение полноэкзомного секвенирования показано:

• когда клиническая картина заболевания гетерогенна и предполагает дифференциальный диагноз в рамках широкого спектра генетически-детерминированных заболеваний;
• когда заболевание является наследственным, но количество потенциальных генов-кандидатов велико;
• когда другими базовыми методами (кариотипирование, «точечное» генетическое обследование) не удалось установить причину заболевания, но есть высокая вероятность его генетической природы.

С какой целью выполняют исследование

С целью диагностики при наличии неврологической картины нейропатии в случае, когда предполагается генетическая причина заболевания (болезнь Шарко-Мари-Тута и ее генокопии, наследственные сенсорные и автономные нейропатии, дистальные наследственные моторные нейропатии, нейропатии, связанные со спастической параплегией, семейная амилоидная полинейропатия и др.).

Литература

1. Клинические рекомендации. Острые порфирии. МЗ РФ. – 2024.
2. Кутлубаева Р. Ф. и др. Наследственные спастические параплегии //Нервно-мышечные болезни. – 2023. – Т. 13. – №. 4. – С. 74-82.
3. Adams D. et al. Hereditary transthyretin amyloid neuropathies: advances in pathophysiology, biomarkers, and treatment //The Lancet Neurology. – 2023. – Т. 22. – №. 11. – С. 1061-1074.
4. Attarian S. et al. Hereditary neuropathy with liability to pressure palsies //Journal of Neurology. – 2020. – Т. 267. – №. 8. – С. 2198-2206.
5. Horvath R. et al. Peripheral neuropathy in mitochondrial disease //Handbook of clinical neurology. – 2023. – Т. 194. – С. 99-116.
6. Morena J., Gupta A., Hoyle J. C. Charcot-Marie-Tooth: from molecules to therapy //International journal of molecular sciences. – 2019. – Т. 20. – №. 14. – С. 3419.
7. Pilotto F., Del Bondio A., Puccio H. Hereditary ataxias: from bench to clinic, where do we stand? //Cells. – 2024. – Т. 13. – №. 4. – С. 319.
8. Schwartzlow C., Kazamel M. Hereditary sensory and autonomic neuropathies: adding more to the classification //Current neurology and neuroscience reports. – 2019. – Т. 19. – №. 8. – С. 52.
9. Sullivan R. et al. Spinocerebellar ataxia: an update //Journal of neurology. – 2019. – Т. 266. – №. 2. – С. 533-544.
10. Tazir M., Nouioua S. Distal hereditary motor neuropathies //Revue Neurologique. – 2024. – Т. 180. – №. 10. – С. 1031-1036.

Правила подготовки к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

Показания для анализа «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных полинейропатий»:

• исследование показано при наличии неврологической картины нейропатии в случае, когда предполагается генетическая причина заболевания (болезнь Шарко-Мари-Тута и ее генокопии, наследственные сенсорные и автономные нейропатии, дистальные наследственные моторные нейропатии, нейропатии, связанные со спастической параплегией, семейная амилоидная полинейропатия и др.);
• обследование кровных родственников пациента с доказанной генетической формой нейропатии.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: нет.

Формат представления результата

Качественный.

Интерпретация результатов исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных полинейропатий»

Информация по интерпретации предоставляется на отдельном бланке.