Полноэкзомное секвенирование панели генов нейродегенеративных заболеваний центральной нервной системы (Whole-exome sequencing of a gene panel of neurodegenerative diseases of the central nervous system)

Синонимы: Исследование панели генов нейродегенеративных заболеваний центральной нервной системы по результатам полноэкзомного секвенирования.

Study of gene panel of neurodegenerative diseases of the central nervous system based on the results of whole-exome sequencing.

Краткое описание исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов нейродегенеративных заболеваний центральной нервной системы»

Нейродегенеративные заболевания – это группа наследственных и приобретенных заболеваний нервной системы, характеризующихся прогрессирующей гибелью определенных групп нейронов и постепенно нарастающей атрофией соответствующих отделов головного мозга, приводящих к деменции, двигательным и прочим неврологическим нарушениям. Наследственность – ведущий фактор возникновения многих нейродегенеративных заболеваний.

Основные формы нейродегенеративных заболеваний:

• болезнь Альцгеймера;
• семейная фронтотемпоральная деменция;
• наследственные лейкодистрофии и лейкоэнцефалопатии;
• мозжечковые атаксии (включая спиноцеребеллярные атаксии);
• болезнь Паркинсона;
• первичные дистонии;
• церебральная болезнь мелких сосудов;
• синдромальные заболевания с нейродегенерацией (синдром Ретта, болезнь Вильсона-Коновалова, болезнь Тея-Сакса, синдром Лёша-Нихена и др.).

Что такое полноэкзомное секвенирование?

Полноэкзомное секвенирование – это высокотехнологичный метод анализа ДНК, прочитывающий все белок-кодирующие участки генома (экзом), содержащие ~85% известных мутаций (патогенных вариантов). Полноэкзомное секвенирование выявляет:

• однонуклеотидные замены (SNV);
• малые инсерции/делеции (in/del) до 50 п.н.;
• некоторые вариации числа копий (CNV).

Когда исследование затруднено

Выявление некоторых типов вариантов методом экзомного секвенирования затруднено или невозможно. К таким вариантам относятся:

• структурные изменения хромосом (инверсии, транслокации, делеции, амплификации);
• полиплоидии;
• анеуплоидии;
• варианты, ассоциированные с протяженными участками триплетных и других повторов;
• варианты в генах с наличием в геноме близкого по последовательности псевдогена или паралога;
• варианты в GC-богатых участках;
• варианты в интронах за пределами канонических сайтов сплайсинга;
• эпигенетические варианты.

Метод имеет ограниченную чувствительность в отношении вариантов в состоянии мозаицизма.

Выполнение полноэкзомного секвенирования показано:

• когда клиническая картина заболевания гетерогенна и предполагает дифференциальный диагноз в рамках широкого спектра генетически-детерминированных заболеваний;
• когда заболевание является наследственным, но количество потенциальных генов-кандидатов велико;
• когда другими базовыми методами (кариотипирование, «точечное» генетическое обследование) не удалось установить причину заболевания, но есть высокая вероятность его генетической природы.

С какой целью выполняют исследование

С целью дифференциальной диагностики нейродегенеративных заболеваний.

Литература

1. Заваденко Н. Н. и др. Прионные заболевания человека: современные аспекты //Журнал неврологии и психиатрии им. СС Корсакова. – 2018. – Т. 118. – №. 6. – С. 88-95.
2. Клинические рекомендации. Болезнь Паркинсона, вторичный паркинсонизм и другие заболевания, проявляющиеся синдромом паркинсонизма. МЗ РФ. – 2021.
3. Клинические рекомендации. Болезнь Фабри. МЗ РФ. – 2024.
4. Клинические рекомендации. Дистония. МЗ РФ. – 2024.
5. Клинические рекомендации. Классическая фенилкетонурия и другие виды гиперфенилаланинемии. МЗ РФ. – 2024.
6. Клинические рекомендации. Когнитивные расстройства у лиц пожилого и старческого возраста. МЗ РФ. – 2024.
7. Клинические рекомендации. Нарушения обмена меди (болезнь Вильсона). МЗ РФ. – 2024.
8. Lynch D. S. et al. Practical approach to the diagnosis of adult-onset leukodystrophies: an updated guide in the genomic era //Journal of Neurology, Neurosurgery & Psychiatry. – 2019. – Т. 90. – №. 5. – С. 543-555.
9. Pilotto F., Del Bondio A., Puccio H. Hereditary ataxias: from bench to clinic, where do we stand? //Cells. – 2024. – Т. 13. – №. 4. – С. 319.
10. Sarret C. Leukodystrophies and genetic leukoencephalopathies in children //Revue neurologique. – 2020. – Т. 176. – №. 1-2. – С. 10-19.
11. Sullivan R. et al. Spinocerebellar ataxia: an update //Journal of neurology. – 2019. – Т. 266. – №. 2. – С. 533-544.
12. Vinters H. V. et al. Vascular dementia: clinicopathologic and genetic considerations //Neuropathology and Applied Neurobiology. – 2018. – Т. 44. – №. 3. – С. 247-266.

Правила подготовки к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

Показания для анализа «Полноэкзомное секвенирование панели генов нейродегенеративных заболеваний центральной нервной системы»:

• различные формы нейродегенеративных заболеваний (болезнь Альцгеймера, фронтотемпоральная деменция, лейкодистрофии и лейкоэнцефалопатии, спиноцеребеллярные атаксии и другие мозжечковые атаксии, болезнь Паркинсона, первичные дистонии, стриатонигральные дегенерации, церебральная болезнь мелких сосудов и др.), при которых предполагается наличие генетической/наследственной/семейной формы заболевания;
• обследование кровных родственников пациента с доказанной генетической формой нейродегенеративного заболевания.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: нет.

Формат представления результата

Качественный.

Интерпретация результатов исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов нейродегенеративных заболеваний центральной нервной системы»

Информация по интерпретации предоставляется на отдельном бланке.