Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных опухолевых синдромов (Whole exome sequencing of a gene panel for hereditary cancer syndromes)

Синонимы: Исследование панели генов наследственных опухолевых синдромов по результатам полноэкзомного секвенирования.

Study of a panel of genes for hereditary tumor syndromes based on the results of whole exome sequencing.

Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных опухолевых синдромов

Синдромы предрасположенности к полипам и раку желудочно-кишечного тракта

Синдромы предрасположенности к эндокринным неоплазиям

Синдромы предрасположенности к раку почки

Факоматозы и нейрокутанные синдромы

Синдромы предрасположенности к саркомам и опухолям мягких тканей

Синдромы предрасположенности к гематологическим злокачественным новообразованиям

Синдромы предрасположенности к раку молочной железы и

яичников

Синдромы предрасположенности к раку кожи и меланоме

RAS-патии (синдромы нарушения развития с онкологическим риском)

Прочие синдромы с уникальными опухолевыми спектрами

Генетическое заключение

Краткое описание исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных опухолевых синдромов»

Наследственные опухолевые синдромы – это группа заболеваний, характеризующихся повышенным риском развития злокачественных образований в течение жизни. Распространенность наследственных опухолевых синдромов при разных типах в среднем составляет 10-15%. Большинство наследственных опухолевых синдромов повышают риски развития злокачественных образований в нескольких локализациях.

Клинически наследственные опухолевые синдромы имеют ряд характерных черт:

• молодой возраст появления опухолей;
• более агрессивное течение;
• семейный анамнез болезни.

Важным понятием в контексте наследственного рака является пенетрантность – вероятность развития заболевания при носительстве патогенного варианта в гене, изменения в котором предрасполагают к его появлению. В контексте злокачественных образований данное понятие подразумевает, что при выявлении носительства патогенного варианта в одном из исследованных генов у пациента без выявленного злокачественного образования риск появления рака в течение жизни не равен 100%, то есть выявление патогенных изменений в одном из исследованных генов не является диагнозом злокачественного образования. Однако выявление данного патогенного варианта при отсутствии опухоли позволяет изменить подходы к скринингу злокачественных образований у пациента и в некоторых случаях провести профилактические медицинские манипуляции, снижающие риск развития заболевания. Выявление патогенного или вероятно патогенного варианта при идентифицированном опухолевом образовании значительно влияет на тактику терапевтического (использование специфической схемы химиотерапии, назначение таргетной терапии) и хирургического лечения пациента, а также является показанием к обследованию родственников первой линии больного.

Что такое полноэкзомное секвенирование?

Полноэкзомное секвенирование – это высокотехнологичный метод анализа ДНК, прочитывающий все белок-кодирующие участки генома (экзом), содержащие ~85% известных мутаций (патогенных вариантов). Полноэкзомное секвенирование выявляет:

• однонуклеотидные замены (SNV);
• малые инсерции/делеции (in/del) до 50 п.н.;
• некоторые вариации числа копий (CNV).

Когда исследование затруднено

Выявление некоторых типов вариантов методом экзомного секвенирования затруднено или невозможно. К таким вариантам относятся:

• структурные изменения хромосом (инверсии, транслокации, делеции, амплификации);
• полиплоидии;
• анеуплоидии;
• варианты, ассоциированные с протяженными участками триплетных и других повторов;
• варианты в генах с наличием в геноме близкого по последовательности псевдогена или паралога;
• варианты в GC-богатых участках;
• варианты в интронах за пределами канонических сайтов сплайсинга;
• эпигенетические варианты.

Метод имеет ограниченную чувствительность в отношении вариантов в состоянии мозаицизма.

Выполнение полноэкзомного секвенирования показано:

• когда клиническая картина заболевания гетерогенна и предполагает дифференциальный диагноз в рамках широкого спектра генетически-детерминированных заболеваний;
• когда заболевание является наследственным, но количество потенциальных генов-кандидатов велико;
• когда другими базовыми методами (кариотипирование, «точечное» генетическое обследование) не удалось установить причину заболевания, но есть высокая вероятность его генетической природы.

С какой целью выполняют исследование

С целью выявления наследственных опухолевых синдромов, выявление наследственной предрасположенности к злокачественным новообразованиям.

Что может повлиять на результат исследования

Нарушение правил подготовки может повлиять на результат.

Литература

1. Белышева Т. С. и др. Пигментная ксеродерма: клинико-генетические особенности и терапевтические подходы //Вопросы современной педиатрии. – 2021. – Т. 20. – №. S6. – С. 611-617.
2. Клинические рекомендации. Гастроинтестинальные стромальные опухоли. МЗ РФ. – 2024.
3. Клинические рекомендации. Нейроэндокринные опухоли. Клинические рекомендации МЗ РФ. – 2025.
4. Клинические рекомендации. Рак молочной железы. МЗ РФ. – 2021.
5. Клинические рекомендации. Рак ободочной кишки и ректосигмоидного перехода. МЗ РФ. – 2025.
6. Клинические рекомендации. Рак паренхимы почки. Клинические рекомендации МЗ РФ. – 2025.
7. Клинические рекомендации. Ретинобластома. Клинические рекомендации МЗ РФ. – 2025.
8. Юсупова Л. А. и др. Факоматозы: диагностика, клиника и особенности течения различных форм заболевания //Лечащий врач. – 2018. – №. 5. – С. 35.
9. Панферова А. В., Тимофеева Н. М., Ольшанская Ю. В. Генетическая диагностика анемии Фанкони. Обзор литературы //Онкогематология. – 2016. – №. 3. – С. 76-85.
10. Степанов И. А. и др. Особенности наследственного TP53-ассоциированного опухолевого синдрома //Вопросы онкологии. – 2022. – Т. 68. – №. 2. – С. 140-148.
11. Tamura R. Current understanding of neurofibromatosis type 1, 2, and schwannomatosis //International journal of molecular sciences. – 2021. – Т. 22. – №. 11. – С. 5850.

Правила подготовки к исследованию

Специальной подготовки не требуется.

Показания для анализа «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных опухолевых синдромов»:

• выявления наследственных опухолевых синдромов, выявление наследственной предрасположенности к злокачественным новообразованиям;
• обследование кровных родственников пациента с доказанной наследственной формой опухолевого синдрома.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Единицы измерения: нет.

Референсные значения: нет.

Формат представления результата

Качественный.

Интерпретация результатов исследования «Полноэкзомное секвенирование панели генов наследственных опухолевых синдромов»

Информация по интерпретации предоставляется на отдельном бланке.