Грибковые инфекции – выявление и типирование возбудителей микозов родов Candida, Malassezia, Saccharomyces и Debaryomyces (Mycotic infection – detection and typing of pathogens causing mycoses from genus Candida, Malassezia, Saccharomyces and Debaryomyces

Синонимы: Кандидоз; Грибковые инфекции; Микозы; Микозоскрин.

Краткое описание исследования «Грибковые инфекции – выявление и типирование возбудителей микозов»

Инфекции, обусловленные дрожжевыми грибами, имеют широкий спектр клинических проявлений: от локального поражения кожи, слизистых оболочек урогенитальной, дыхательной систем и желудочно-кишечного тракта до фунгемии и полиорганного поражения. Являясь представителями условно-патогенной микробиоты макроорганизма, при определенных условиях дрожжевые грибы могут вызывать инфекционно-воспалительные поражения кожи и слизистых, а также тяжелые патологические состояния.

Основными представителями дрожжевых грибов являются:

Грибы рода Сandida – их насчитывают более 100 видов, патогенны для человека С. albicans, C. tropicalis, C. krusei, C. lusitaniae, C. kefyr, C. glabrata, C. guilliermondii, C. parapsilosis, C. famata (Debaryomyces hansenii), С. auris и др. Многие из них обладают обладает устойчивостью к противогрибковым препаратам и являются причиной фунгемии.

Грибы рода Saccharomyces являются условно-патогенными микроорганизмами, в норме их выделяют со слизистой оболочки ротовой полости, влагалища, обнаруживают в кале, мокроте и других видах биоматериала. Среди грибов, относящихся к роду Saccharomyces, инфекционную патологию вызывает вид Saccharomyces cerevisiae. В группе риска инфицирования находятся пациенты с низкой реактивностью иммунной системы; недоношенные дети; пациенты, принимающие пробиотические препараты; работники пищевой промышленности, которые непосредственно контактируют с пекарскими/пивными дрожжами.

Грибы вида Malassezia являются представителями нормальной микрофлоры кожи человека, которые при соответствующих условиях могут вызывать поверхностную инфекцию кожи или инвазивные поражения.

Заболевания, вызываемые дрожжевыми грибами, делятся на две группы: поверхностные и инвазивные микозы. Поверхностные микозы – это грибковое поражение слизистых оболочек, кожи и ее придатков, широко распространенное заболевание, поражающее поверхностные слои эпителия. К поверхностным микозам относятся: вульвовагинальный кандидоз (ВВК) – причина таких осложнений как уретрит, цистит, воспалительные заболевания органов малого таза, акушерская патология, инфицирование плода, послеродовый эндометрит и сальпингит; орофарингеальный кандидоз, а также дерматозы, ассоциированные с дрожжевыми грибами.

Наиболее частым этиологическим фактором возникновения ВВК и орофарингеального кандидоза выступает C. albicans, составляя 50-89% случаев. Однако в последнее время увеличивается доля видов Candida non-albicans: C. glabrata (29,5-50,4%), C. parapsilosis (13,7%), C. tropicalis (10,7-17,9%), C. krusei (Pichia kudriavzevii) (10,9%), C. lusitaniae (Clavispora lusitaniae) и C. kefyr (Kluyveromyces marxianus) (7,2%). Другие виды, такие как C. guilliermondii (Meyerozyma guilliermondii), С. dubliniensis регистрируются значительно реже – от 0,2 до 3,7%. В 11,8-16,2% случаях причиной ВВК могут стать дрожжи Saccharomyces cerevisiae, симптомы заболевания будут соответствовать кандидозной этиологии, но степень выраженности клинической картины значительно меньше.

Грибы рода Malassezia принимают непосредственное участие в патогенезе таких заболеваний как атопический дерматит, псориаз, микробная экзема, нейродермит и т. д., оказывая усугубляющее влияние на их течение.

Для подтверждения наличия кандидозной инфекции необходима не только качественная, но и количественная оценка дрожжевых грибов, проводимая в сопоставлении с клинической симптоматикой, с учетом наличия фоновых заболеваний, микст-инфекции.

Инвазивные микозы являются тяжелой формой грибкового инфицирования организма, требующей длительного системного лечения. При таком заболевании возбудители микозов проникают в крово- и лимфоток, вызывая кандидемию, и распространяются по всему организму, поражая внутренние органы. Ежегодно в мире регистрируется около 250 000 случаев инвазивного кандидоза (ИК), в России данный показатель составляет более 10 000. К группам риска относят пациентов, находящихся в ОРИТ (отделение реанимации и интенсивной терапии), пациентов с заболеваниями, сопровождающимися нейтропенией (гемобластозы, солидные опухоли, трансплантация кроветворных стволовых клеток), недоношенные новорожденные с экстремально низкой массой тела (ЭНМТ). Примерно в 90% случаев причиной фунгемий и инвазивных микозов являются грибы рода Candida. Самым патогенным и часто встречающимся является вид C. albicans (48-54%), реже диагностируются C. glabrata (13,8-23%), C. parapsilosis (11-18,5%), C. auris (10%), C. tropicalis (6-10%), C. krusei (2-2,5%).

Своевременная постановка грамотного диагноза и выбор рациональной тактики лечения основаны на корректной видовой идентификации и количественном определении грибов. Культуральная диагностика на данный момент не дает такой возможности и одним из наиболее эффективных подходов, которые можно использовать для решения этой задачи, являются молекулярно-генетические методы с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР).

Аналитические показатели

Анализируются: Meyerozyma guilliermondii (Candida guilliermondii); Candida albicans; Pichia kudriavzevii (Candida krusel); Saccharomyces cerevisiae; Candida auris; Candida tropicalis; Clavispora lusitaniae (Candida lusitaniae); Debaryomyces hansenii (Candida famata); Candida dubliniensis; Candida glabrata; Candida parapsilosis; Malassezia species; Malassezia furfur; Kluyveromyces marxianus (Candida kefyr).

С какой целью выполняют исследование

Исследование предназначено для выявления и типирования возбудителей грибковых инфекций в препаратах ДНК, полученных из биологического материала человека.

Показанием к проведению анализа является подозрение на кандидоз, кандидемию, кандидурию или кандидоносительство.

Что может повлиять на результат исследования

Нарушение правил подготовки к исследованию может повлиять на результат теста.

Материал для исследования

Моча.

Мокрота.

Соскоб эпителиальных клеток урогенитальный.

Соскоб эпителиальных клеток носоглотки.

Соскоб эпителиальных клеток ротоглотки.

Соскоб эпителиальных клеток прямой кишки.

Литература

1. Антонов А. Г., Никитина И. В., Митрохин С. Д. Клинические рекомендации по профилактике и лечению грибковых инфекций у новорожденных в условиях отделения реанимации и интенсивной терапии //Неонатология: Новости. Мнения. Обучение. – 2013. – №. 2 (2). – С. 80-88.
2. Диагностика и лечение микозов в отделениях реанимации и интенсивной терапии: российские рекомендации / Отв. ред. Н. Н. Климко. – 2-е изд. доп. и перераб. – М.: Фармтек, 2015. – 96 с.
3. Микозоскрин: диагностика инфекций, вызванных дрожжевыми грибами.
4. Никитина И. В. и др. Инвазивные микозы в неонатологии: профилактика, диагностика и терапия //Акушерство и гинекология. – 2015. – №. 8. – С. 18-25.
5. Оганесян Э. Г. и др. Проблемы медицинской микологии //Проблемы медицинской микологии. Учредители: Северо-Западный государственный медицинский университет им. ИИ Мечникова. – 2021. – Т. 23. – №. 3. – С. 72-77.
6. Barton M. et al. Invasive candidiasis in low birth weight preterm infants: risk factors, clinical course and outcome in a prospective multicenter study of cases and their matched controls //BMC infectious diseases. – 2014. – Т. 14. – С. 1-10.
7. Greenberg R. G. et al. Empiric antifungal therapy and outcomes in extremely low birth weight infants with invasive candidiasis //The Journal of pediatrics. – 2012. – Т. 161. – №. 2. – С. 264-269. e2.
8. Lone S. A., Ahmad A. Candida auris—the growing menace to global health //Mycoses. – 2019. – Т. 62. – №. 8. – С. 620-637.

Правила подготовки к исследованию

Специальной подготовки к исследованию не требуется. С общими рекомендациями для подготовки к исследованиям можно ознакомиться здесь.

Рекомендуется брать материал не ранее, чем через 14 дней после применения антибактериальных препаратов и местных антисептиков, и не ранее, чем через один месяц после применения антибиотиков перорально.

Интерпретация результатов исследований содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Референсные значения: нет.

Формат представления результата

Тест полуколичественный. Результат исследования выражен десятичным логарифмом количества копий ДНК-мишени в 1 мл препарата ДНК.

В тест-систему включен контроль взятия материала (КВМ). В случае, если значение КВМ меньше 3,0 Lg, это интерпретировать как недостаточное количество материала и рекомендуется повторное взятие материала для исследования. Для образцов мочи данный параметр не учитывается.

Трактовка результатов исследования «Грибковые инфекции – выявление и типирование возбудителей микозов»

Обнаружено

В анализируемом образце биологического материала обнаружены фрагменты ДНК, специфичные для исследуемого микроорганизма.

К результату «обнаружено» добавляется комментарий с указанием уровня выявленной бактериальной ДНК в lg копий/мл.

Не обнаружено

В анализируемом образце биологического материала не обнаружено фрагментов ДНК, специфичных для исследуемых микозов, или концентрация возбудителей в образце ниже границы чувствительности метода.

Обращаем внимание, что сроки выполнения ПЦР-исследований могут быть увеличены при проведении подтверждающих тестов.