Метод определения
полимеразная цепная реакция
Исследуемый материал
фиксированные формалином и залитые парафином блоки тканей со стеклами
Тест используется для определения наличия транслокаций EML4-ALK для решения вопроса о проведении таргетной терапии.
Транслокации гена ALK играют ключевую роль в патогенезе некоторых видов злокачественных новообразований. Данный ген был впервые обнаружен при анапластической крупноклеточной лимфоме и, следовательно, назван киназой анапластической лимфомы. В 2007 году впервые обнаружена транслокация ALK в солидных опухолях, а именно в немелкоклеточном раке легкого (НМРЛ). Данная альтерация гена происходит в результате межхромосомной инверсии в коротком плече хромосомы 2 [Inv (2) (p21p23)]. Это приводит к слиянию экзонов 1-13 гена EML4 с экзонами 20-29 гена ALK. Полученный белок EML4-ALK содержит N-концевой участок, кодируемый геном EML4, и С-концевой участок (внутриклеточный участок тирозинкиназного рецептора), кодируемый геном ALK. Онкогенный белок слияния EML4-ALK имеет конституционально активированный киназный домен. Это приводит к усилению активности сигнальных путей PI3K-AKT, CRKL-C3G, MEKK2/3-MEK5-ERK5, JAK-STAT и MAPK, что ведет к пролиферации клеток и ингибированию апоптоза.
Транслокации гена ALK обнаруживаются в 2-5% случаев НМРЛ и ассоциированы с молодым возрастом пациентов, отсутствием статуса курения в анамнезе, и гистологически представлены аденокарциномой. Наиболее частым партнером слияния гена ALK при НМРЛ является ген EML4, что приводит к образованию аберрантного белка EML4-ALK. Вариант 1 [e13:a20] и вариант 3а/b [e6:a20] являются наиболее распространенными вариантами перестройки EML4-ALK, которые обнаруживаются в 33% и 29% случаев EML4-ALK-позитивного НМРЛ, соответственно. Кроме этого, было обнаружено, что партнерами транслокации гена ALK могут также служить такие гены, как KIF5B, TFG и KLC-1 (<1%). Определение транслокаций ALK рекомендовано у пациентов с метастатическим НМРЛ для определения возможности применения таргетной терапии тирозинкиназными ингибиторами ALK (RUSSCO 2019).