Метод определения
Полимеразная цепная реакция
Исследуемый материал
фиксированные формалином и залитые парафином блоки тканей со стеклами
Синонимы: IDH1 mutations.
Краткая характеристика исследования Мутации в гене IDH1
Семейство ферментов изоцитратдегидрогеназы (IDH) включает три изоформы, расположенные в цитоплазме, пероксисомах (IDH1) и митохондриях (IDH2 и IDH3). Ферменты IDH участвуют в ряде клеточных процессов, включая митохондриальное окислительное фосфорилирование, метаболизм глутамина, липогенез и регуляцию клеточного окислительно-восстановительного статуса. IDH1 и IDH2 – очень похожие белки, оба катализирующие обратимое окислительное декарбоксилирование изоцитрата до альфа-кетоглутарата при восстановлении NADP+ до NADPH.
Ген IDH1 расположен на хромосоме 2q33.3. Почти все мутации IDH являются гетерозиготными соматическими точечными мутациями, которые группируются в активных сайтах фермента IDH1, что приводит к замене аминокислоты аргинина 132 в IDH1. Мутации в данном гене приводят к накоплению D-2-гидроксиглутарата, что обуславливает нарушение широкого спектра клеточных процессов, таких как гипоксия, ангиогенез, созревание коллагенов внеклеточного матрикса и эпигенетическая регуляция.
Определение мутаций в генах IDH1 рекомендовано всем пациентам с глиомой для классификации заболевания согласно системе ВОЗ. Наличие мутации в данных генах ассоциированы с наличием метилирования гена MGMT. Пациенты с инфильтративной глиомой II и III степени злокачественности и наличием мутаций в генах IDH1/2 имеют более благоприятный прогноз в отличие от пациентов с отсутствием мутаций в указанных генах. Также пациенты с наличием мутации в генах IDH1/2 демонстрируют лучше ответ на лучевую терапии и на терапию алкилирующими препаратами.
С какой целью определяют Мутации в гене IDH1
Исследование применяют в целях определения наличия активирующих мутаций в гене IDH1 для возможности персонализации терапии.